Фамилия Клюхина — яркий пример того, как за простым прозвищем может скрываться сразу несколько версий происхождения. Основа у неё одна — прозвище Клюха, а вот его значение толкуют по-разному.

Самое прямое объяснение отсылает к слову «клюка» — изогнутая палка, посох. В этом случае Клюхой называли человека, который не расставался с клюкой: либо пожилого, либо хромого, либо сутулого, кому опора была необходима. Однако это не единственная и, по мнению архангельского краеведа М. С. Медведева, не самая точная версия для северных говоров. Он указывает на местные слова «клюй» и «клюиха» — они означали сонливого человека, того, кто «клюет носом». Тогда прозвище Клюха закреплялось за медлительным, вялым или любившим поспать человеком. Эта версия выглядит убедительнее, поскольку опирается на живую диалектную лексику.

Есть и третья гипотеза, связывающая прозвище с прилагательным «клювый». В старых говорах у этого слова было два полюса значений: «красивый, статный, видный» и, наоборот, «человек с длинным, похожим на клюв носом». Какое из них легло в основу прозвища — сказать трудно, но обе возможности существовали.

Фамилия образована по простой и распространённой модели: к основе мужского прозвища Клюха добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин. Получилось «чей?» — Клюхин, то есть сын, потомок Клюхи. Со временем форма закрепилась как фамилия, и в женском роде она звучит как Клюхина. Таким образом, предки современных носителей этой фамилии могли быть либо людьми с палкой-опорой, либо сонями, либо обладателями приметной внешности — какая из версий верна, без генеалогического исследования не определить.