Фамилия Клюшнева образована от прозвища Клюшень, которое восходит к нарицательному «клюша» (клюка), имеющему значение «палка, трость с загибом». Скорее всего, Клюшнем прозвали сутулого человека. Согласно другой версии, в основе прозвища Клюшень лежит нарицательное «клюша» в значении «род токарного долота, для обточки чугунных пушек». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Клюшень, со временем получил фамилию Клюшнева.