Фамилия Клюсовец — редкий пример фамилии, образованной не напрямую от прозвища, а через топоним. В её основе лежит название населённого пункта Клюсово. Такие деревни и сёла действительно существовали и существуют в России — например, в Тюменской и Московской областях. Суффикс -ец в фамилиях такого типа (ср. Томск — Томец, Ростов — Ростовец) традиционно указывал на выходца из определённой местности: Клюсовец — это «тот, кто родом из Клюсово».

Само название Клюсово, скорее всего, связано с глаголом «клюсить». В русских говорах это слово означало «моросить» — то есть идти мелкому, затяжному дождю. Отсюда идёт и другая, более прозрачная версия: прозвище Клюсовец могли дать ребёнку, родившемуся в пасмурный, дождливый день. Такие «погодные» имена в крестьянской среде встречались нередко — они были просты, понятны и не требовали объяснений.

Словообразовательная модель здесь двойная: сперва от глагольной основы «клюс-» возник топоним (или непосредственно прозвище), а затем с помощью суффикса -ец оформилась фамилия. Если бы фамилия звучала как Клюсов, она бы указывала на прямого потомка человека по прозвищу Клюс, но форма на -ец чётко привязывает носителя к месту — к Клюсову, а не к личности.

Спор между двумя версиями разрешается просто: топонимическая гипотеза надёжнее, потому что фамилии на -ец в русской ономастике почти всегда указывают на географическое происхождение. Версия с «пасмурным днём» возможна, но она вторична — скорее всего, так могли переосмыслить фамилию уже после её возникновения.