Фамилия Коклюшкины — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранило почти первозданный вид и не растворилось в потоке стандартных «Ивановых» и «Петровых». В центре внимания здесь слово «коклюшка». Это не уменьшительное от «коклюха» (так кое-где называли пьяницу или неопрятного человека), а прямой инструментальный термин. Коклюшка — деревянная палочка с утолщением на конце, на которую наматывают нитки для плетения кружев. В русском кружевном промысле, особенно в Вологодской, Елецкой и Рязанской губерниях, коклюшка была главным орудием мастерицы.

Отсюда и происхождение фамилии. Скорее всего, Коклюшкиным назвали человека, который делал эти самые коклюшки — точел их из дерева. В среде ремесленников такое прозвище могло закрепиться за токарем или резчиком по дереву, работавшим на кружевных мануфактурах или на заказ для мастериц. Менее вероятно, но не исключено, что прозвище «Коклюшка» дали самому кружевнику — мужчине, который занимался этим тонким ремеслом (в XIX веке встречались и мужчины-кружевники, особенно в слободах).

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — коклюшкин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Коклюшка. Форма множественного числа «Коклюшкины» закрепилась за целым родом, когда на вопрос «чьи вы будете?» отвечали: «Коклюшкины». Фамилия недворянская, типично крестьянская или мещанская, и её география напрямую связана с центрами кружевоплетения: Вологодская область, Рязанская (Михайловский уезд), Орловская (Елец). Встречается она редко, что делает её ценным маркером конкретного ремесленного прошлого, а не расплывчатого прозвища.