Фамилия Коклин — одна из тех, где за простым звучанием скрывается сразу несколько версий происхождения, и ни одна из них не очевидна на первый взгляд. Скорее всего, в её основе лежит прозвище Кокля. Самая интересная версия связывает это прозвище с латышским словом «кокле» — так называется народный струнный инструмент, напоминающий гусли. В этом случае Коклей могли прозвать гусляра, музыканта, который ходил по ярмаркам или играл на пирах. Версия не экзотическая, а вполне рабочая: на северо-западе Руси, в соседстве с балтийскими землями, такие заимствования в прозвищах встречались.

По другой версии, Кокля — это сокращение от «коклюшник», то есть человек, который делал коклюшки для плетения кружев или сам ими занимался. Прозвище по ремеслу — один из самых частых источников русских фамилий, так что и этот вариант правдоподобен. Наконец, нельзя исключать, что Кокля — это производное от диалектного слова «коклюшка» в значении «палка, клюка», и прозвище могли дать человеку с характерной походкой или внешностью.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Кокл- добавился суффикс принадлежности -ин, который отвечал на вопрос «чей?». Коклин — буквально «сын Кокли» или «человек из рода Кокли». Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я.

Что касается географии, фамилия Коклин встречается не повсеместно, а скорее пятнами — в старых писцовых книгах Новгородской и Псковской губерний, что косвенно подтверждает версию о балтийском следе. В центральных областях она редка.

Точное время возникновения фамилии сейчас установить трудно: процесс оформления фамилий у крестьян и посадских людей растянулся на несколько веков. Но сама словообразовательная модель — прозвище на -я плюс суффикс -ин — говорит о том, что фамилия могла сложиться не позднее XVII века.