Фамилия Коквины — редкий пример, где прозвище перешло в фамилию почти без изменений, через модель на -ин. Основа здесь — «коква». В русских говорах это слово имело несколько значений, и чтобы понять, кем был первый Коквин, нужно выбрать самое вероятное.

В диалектах русского Севера и Сибири «коква» — это неряшливый, неопрятный человек, грязнуля. В архангельских и вятских говорах слово фиксируется именно в этом значении. Фамилия, скорее всего, родилась именно там: прозвище Коква дали человеку за небрежность в одежде или быту, а его дети стали Коквиными. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Коквин, то есть сын или потомок Коквы.

Есть и другая версия, но она слабее. В некоторых регионах «коква» могло быть искажённым произношением слова «кокон» или относиться к чему-то скрученному, свёрнутому. Однако для фамилии такая основа маловероятна: прозвища по внешнему виду или характеру давались гораздо чаще, чем по предметам быта. География фамилии это косвенно подтверждает: Коквины встречаются в основном на Русском Севере, особенно в Архангельской области и в бывших северных уездах Вологодской губернии.

Фамилия недворянская и нестарая — такие прозвищные фамилии на -ин массово закрепились в XVI–XVII веках у крестьян и посадских людей. Коквины, вероятно, были черносошными крестьянами или ремесленниками, и их фамилия — прямое отражение деревенского быта, где меткое слово могло стать родовым именем.