Фамилия Коквин — редкий случай, когда корень почти наверняка не русский, а финно-угорский или прибалтийско-финский. В исконно русских фамилиях сочетание «кв» встречается крайне редко, и если отбросить маловероятные версии про искусственное происхождение или искажение при переписи, остается одна уверенная гипотеза: основа восходит к карельскому или вепсскому слову kokko — «орёл». Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Коквин, то есть «сын Кокко» или «из рода Орла». В финно-угорской ономастике это обычная модель: имя-прозвище по тотемному животному (орёл — символ силы и зоркости) переходило в фамилию через русский патронимический суффикс.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу: Карелия, Ленинградская область, Архангельская губерния. Если предки были крестьянами или рыбаками, то прозвище Кокко мог получить человек с орлиным носом, острым взглядом или властным характером. Встречается и вариант Кокконен — типичная финская фамилия с тем же корнем, но с другим суффиксом. Коквин — это уже русифицированная форма, записанная в метриках.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным русским словом «коква» (капризный, придирчивый человек) или с «коковка» (верхушка, шишка). Но фонетика тут не даёт полного совпадения: «коквин» звучит как результат адаптации иноязычного слова. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Коквин не упоминается как типично русская — это дополнительный аргумент в пользу заимствованного корня.

В социальном плане носители фамилии, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, реже — мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Встречаемость крайне низкая: по данным современных телефонных справочников, Коквины живут в основном в Карелии и Мурманской области, что подтверждает северное происхождение.