Фамилия Колоденский — одна из тех, где простое на первый взгляд слово скрывает сразу несколько возможных историй. Её основа — прозвище Колода, а суффикс -ский указывает на то, что фамилия сформировалась в среде польской или украинской шляхты, либо среди духовенства и крестьян, получивших фамилию по названию места. В случае Колоденского это, скорее всего, модель «владельческий»: Колоденский — «тот, кто из Колодного» или «сын Колоды». Но что означало само прозвище — вопрос, на который нет одного короткого ответа.

Самая распространённая версия относит Колоду к профессиональным именованиям. В разных ремёслах «колода» — это и бревно с дуплом для бортей (бортничество), и деревянный жёлоб для воды (водовоз), и часть ткацкого станка, и инструмент кожевника. То есть предок Колоденских мог быть и лесным пчеловодом, и ремесленником, работающим с деревом. Однако есть и менее очевидное значение: на Руси «колодой» называли тяжёлую деревянную оковку на шее арестанта или каторжника. Прозвище в этом случае могло закрепиться за человеком, который побывал в тюрьме, или за тем, кто нёс службу при колодниках (конвоир, тюремщик). Это не обязательно клеймо — в среде, где многие проходили через ссылку, такое прозвище могло стать бытовым.

Не менее правдоподобна и украинская линия. В юго-западных говорах слово «колодій» означало колесника — мастера, который делал колёса для телег и повозок. Поскольку фамилии с суффиксом -ский особенно характерны для Правобережной Украины и бывших земель Речи Посполитой, версия о колеснике-колодіе выглядит логичной. Кроме того, существует глагол «колодить» — «упрямо твердить одно и то же». В этом случае прозвище дали человеку с тяжёлым, занудным характером. Какая из версий истинная для конкретного рода Колоденских — без генеалогических документов сказать трудно, но все они укладываются в логику народного именования: прозвище постепенно вытеснило крестильное имя и перешло в фамилию.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам — Беларуси, Украине и югу России, что косвенно подтверждает связь с украинским «колодій» или владельческим топонимом. Встречаются варианты написания: Колодянский, Колодницкий, но форма Колоденский — одна из самых старых и устойчивых.