Фамилия Колыскова — это женская форма мужской фамилии Колысков, и её происхождение напрямую связано с разговорным прозвищем или именем. В основе фамилии лежит слово «колыска». В русских говорах так называли маленькую детскую кроватку — колыбель, зыбку. Соответственно, прозвище Колыска могли дать человеку, который делал такие колыбели, то есть столяру или плотнику, специализирующемуся на детской мебели. Возможен и другой вариант: прозвище мог получить младший ребёнок в семье, «последыш», которого ещё качали в колыбели, когда старшие дети уже подросли. В этом случае прозвище фиксировало не профессию, а положение в семье.

Фамилия образована по типичной русской модели: к основе «Колыск-» добавился суффикс принадлежности -ов, указывающий на «сына Колыски» или «человека из дома Колыски». Окончание -а в женской форме указывает на женщину, но в быту и документах фамилия чаще всего склоняется как прилагательное: Колыскова, Колысковой, Колыскову.

Географически фамилия Колысков (и Колыскова) встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской, Архангельской и Костромской областях. Это не случайно: именно в этих местах слово «колыска» сохранилось в активном диалектном употреблении дольше, чем в других регионах. На юге России и в Сибири чаще использовали слово «зыбка», поэтому фамилии с корнем «колыск-» там редки.

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что основа не является каноническим крестильным именем. Это чисто прозвищная фамилия, возникшая в крестьянской среде. В отличие от фамилий на -ин (например, Колыскин), суффикс -ов здесь указывает на то, что прозвище было достаточно распространённым и самостоятельным, а не просто уменьшительной формой имени. Однокоренные фамилии — Колыбельников, Колыбанов — имеют схожую семантику, но образованы от разных диалектных вариантов слова «колыбель». Фамилия Колыскова, таким образом, более архаичная и локально привязанная к севернорусским говорам.