Фамилия Комаишко звучит на слух как украинская или белорусская, и это первая подсказка. Её выдает суффикс -ишк- (-ишко), который в восточнославянских фамилиях выполняет сразу две роли: уменьшительно-ласкательную (как в украинском «хлопчисько» — мальчуган) или, реже, пренебрежительную. В польском языке похожий суффикс -iszko/-yszkо тоже встречается, но для фамилии Комаишко украинское или белорусское происхождение выглядит естественнее.

Основа фамилии — «Комай». Это либо прозвище, либо производная форма от крестильного имени. Самый прямой вариант: «Комай» — тот, кто связан с комарами. В народе комара могли прозвать «комай» (сравните с диалектным «команек» или «комарище»). Прозвище Комай давали либо назойливому, либо маленькому и вертлявому человеку, либо тому, кто жил в болотистой местности, где комарья было невпроворот. Такие прозвища по насекомым — не редкость: Жук, Муха, Овод, Комар.

Есть и вторая, менее очевидная версия. «Комай» могло быть сокращением от канонического имени Косма (разговорная форма Кузьма). В украинских говорах имя Кузьма нередко звучало как Кузь, Кузько, а в некоторых диалектах — как Комар или Комай (из-за перестановки звуков или влияния местного произношения). Тогда Комаишко — это «маленький Комай», то есть сын или потомок человека по имени Комай (Кузьма). Такое объяснение правдоподобно, но уступает «комариному» по частоте: фамилии от названий насекомых встречаются чаще, чем от редких форм имени.

Географически фамилия Комаишко тяготеет к западу Украины и югу Беларуси. Встречается в Волынской, Ровенской, Житомирской областях, а также в Брестской области Беларуси. В России она редкая и чаще всего появляется из-за миграций XX века. Сословной принадлежности по фамилии не определить: её носили и крестьяне, и мещане, потому что суффикс -ишко в фамилиях не указывает на знатность или низкое происхождение, а лишь на способ образования.

Однокоренные фамилии — Комай, Комайко, Комаровский, Комаренко. Но Комаишко стоит особняком из-за редкого суффикса: таких фамилий на -ишко в целом немного, и они почти всегда указывают на конкретный регион — западноукраинское или белорусское Полесье. Так что если ваша фамилия Комаишко, предки, скорее всего, жили в лесисто-болотистой местности, где комары были частью быта, или носили имя, которое в народе переделали до неузнаваемости.