Фамилия Комлыгина — женская форма фамилии Комлыгин, и её разбор стоит начать с мужского варианта, потому что именно он хранит ключ к происхождению. Основа фамилии — прозвище Комлыга. В русских говорах так называли неуклюжего, неповоротливого человека, увальня. Слово «комлыга» имеет ту же природу, что и «ком»: что-то сбитое, скомканное, негибкое. Прозвище давали за медлительность или грузную фигуру, но без злого умысла — скорее, как бытовую характеристику.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Комлыгин — это «сын Комлыги» или «человек из семьи Комлыги». Такая модель типична для прозвищ и нецерковных имён, оканчивающихся на -а/-я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от имён на твёрдый согласный, -ин закрепился за основами на мягкий или шипящий, а также за словами женского рода. Комлыга — слово женского рода, поэтому форма на -ин закономерна.

Поскольку прозвище Комлыга не связано с ремеслом или должностью, носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилия редкая и географически привязана к северным и центральным областям России, где активно бытовала диалектная лексика. Встречается она в основном в Вологодской, Архангельской и Костромской губерниях — там, где слово «комлыга» фиксировали этнографические словари.

Стоит заметить, что фамилия могла возникнуть и от другого, менее распространённого значения «комлыги» — в некоторых говорах так называли чурбан или обрубок дерева. В этом случае прозвище мог получить плотник или лесоруб, но первая версия — про характер — выглядит более вероятной, поскольку прозвища по внешним или поведенческим чертам давали чаще, чем по инструменту или предмету труда.

Фамилия Комлыгина не имеет отношения к дворянским родам и не фиксируется в дореволюционных родословных книгах. Это типичная крестьянская фамилия, которая сохранилась до наших дней в основном в тех же регионах, где возникла. Если вы носите эту фамилию, ваши предки, скорее всего, жили на Русском Севере или в Верхнем Поволжье, и их прозвище говорило о характере или внешности, а не о профессии.