Фамилия Комнков — редкий пример того, как одно прозвище могло означать и профессию, и черту характера, а его основа восходит к древнерусскому языку. В основе лежит слово komn, которое в древнерусском имело два основных значения: «конь» и «камень». Эта двойственность и породила несколько версий происхождения фамилии.

По первой версии, прозвище Комнко дали человеку, чья работа была связана с лошадьми: конюху, пастуху или тому, кто ухаживал за табуном. В крестьянском быту конь был главным помощником, и прозвище могло быть уважительным, указывающим на род занятий. Вторая версия отталкивается от значения «камень». Здесь Комнко — прозвище каменщика, строителя, который работал с камнем. В древности каменное зодчество было особым мастерством, и такое прозвище выделяло человека по ремеслу.

Не исключено и переносное значение. Поскольку камень символизирует твёрдость, прозвище Комнко могло закрепиться за человеком с жёстким, несгибаемым характером или за тем, кто отличался физической силой и выносливостью. В этом смысле прозвище сближается с характеристикой «стойкий, как камень» или «крепкий, как конь». Такое многозначное прозвище легко становилось основным именованием человека в быту, а затем перешло в фамилию.

Суффикс -к- в прозвище Комнко — уменьшительно-ласкательный или обиходный, характерный для разговорной речи Древней Руси. Фамилия образовалась по стандартной модели: прозвище на -о перешло в фамилию через суффикс -ов, то есть «сын Комнко». Таким образом, фамилия Комнков буквально значит «принадлежащий Комнку, потомок Комнка». Среди однокоренных фамилий можно назвать Комнев, Комнатов, но Комнков стоит особняком из-за редкой основы komn, которая почти не встречается в современных говорах. Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, где в диалектах дольше сохранялись древнерусские формы.