Фамилия Комняков — редкий случай, когда не до конца ясно даже, с какого слова всё началось. На слух она кажется простой: суффикс -ов указывает на происхождение от отчества или прозвища. Но вот основа «Комняк» — загадка.

Самая вероятная версия связывает её с диалектным словом «ком» в значении «комок, кусок, глыба». В северных и сибирских говорах «комняком» могли называть плотного, коренастого человека, либо того, кто работает с комьями земли — пахаря, землекопа. Суффикс -як в русских прозвищах (ср. Дубняк, Каменяк) часто придаёт слову оттенок свойства или предметности. То есть Комняк — это «комковатый», «сбитый», а фамилия Комняков — «сын Комняка».

Менее распространённая гипотеза выводит основу из тюркских языков, где «ком» или «кём» может означать «печь», «горн», «уголь». В таком случае Комняк — прозвище углежога или кузнеца. Но эта версия слабее: фонетический переход из тюркского в русское «Комняк» неочевиден, и нет устойчивой традиции таких заимствований в фамилиях на -як.

Географически фамилия встречается рассеянно, без явного гнезда — единичные записи есть в Вятской губернии, на Урале и в Сибири. Это косвенно подтверждает связь с севернорусскими говорами и промысловым населением. В отличие от фамилий Комов, Комков (от «ком» напрямую), Комняков сохранила более архаичную и редкую словообразовательную модель.

Сословного барьера у фамилии не было: её могли носить и крестьяне, и мещане. В документах XIX века Комняковы встречаются среди государственных крестьян и отставных солдат. Никаких известных дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это фамилия простого человека, чьё прозвище описывало либо внешность, либо род занятий.