Фамилия Кондраки — один из тех случаев, когда географический акцент важнее морфологического разбора. Перед нами не типичная русская модель на -ов или -ин, а украинская или белорусская форма с усечённым окончанием. Если бы фамилия звучала как Кондраков, сомнений бы не было: отчество от канонического имени Кондрат (народная форма церковного Кондратий). Но суффикс -ак, перешедший в -аки во множественном числе, указывает на иную традицию образования.

В украинской ономастике фамилии на -ак, -ака, -аки часто возникали как прозвищные или патронимические. Кондраки — это либо «потомки Кондрата» (по модели, аналогичной русским фамилиям на -ичи), либо прозвище, данное человеку по какой-то характерной черте, связанной с корнем «кондрак» (например, «кондрашка» — удар, апоплексический удар в просторечии). Вторая версия менее вероятна, но не исключена: прозвища от болезней или физических состояний в крестьянской среде встречались.

Форма множественного числа (Кондраки, а не Кондрак) типична для западных регионов — Правобережной Украины, Подолья, Галиции. Там фамилии часто закреплялись в виде родового имени: «семья Кондраков» превращалась в «Кондраки». Сравните с фамилиями Галай, Галайчук или Бондар, Бондарчук — суффикс -ак здесь работает как уменьшительный или принадлежностный.

В польском языке аналогом выступает фамилия Kondrak, которая могла возникнуть от того же Кондрата, но с польским суффиксом -ak (как в Kowalak — «сын кузнеца»). Носители фамилии Кондраки — это, скорее всего, потомки крестьян или мещан, не получивших дворянского оформления фамилии через притяжательные суффиксы. Фамилия так и осталась в «сыновьей» форме, без перехода в -ов, что и делает её редкой и территориально привязанной.

Встречается также вариант написания с одной «к» — Кондраки, но это орфографическая случайность, не меняющая значения. Основной вывод: перед вами фамилия-маркер западнорусского пограничья, где имя Кондрат дало жизнь не типичному отчеству, а родовому прозвищу во множественном числе.