Фамилия Конишев образована от прозвища Кониш, которое, скорее всего, восходит к нарицательному «конь». Также возможно, что фамилия Конишев имеет тюркские корни и восходит к восточному мужскому имени Коныш, которое переводится как «остановка». Вероятно, такое имя получил ребенок из многодетной семьи, в которой больше не хотели иметь детей. Таким, образом, имя Коныш было призвано остановить процесс деторождения. Также нельзя исключать возможности происхождения фамилии Конишев от казахского прозвища Коныш, что означает «голенище». Так и прозвище Кониш закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Конишев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кониш, со временем получил фамилию Конишев.