Фамилия Конокотина — редкий пример фамилии, в основе которой лежит составное прозвище. Она образована от прозвища Конокот, которое, в свою очередь, сложилось из двух корней: «кон» и «кот». Первая часть многозначна. В разных говорах «кон» означал «начало, предел, межа», а также «ряд, порядок, очередь»; в калужских говорах — даже «гибель». Но есть и глагольная версия: «конить» (перекидывать палку при игре в бабки) или «конать» (кричать, шуметь, тревожить). Вторая часть, «кот», отсылает к домашнему животному. Прозвища с этим корнем давали лукавым, хитрым людям, а также торгашам, которые разъезжали по деревням, меняя безделушки на кошек ради выделки их меха.

Но есть и другой поворот. «Коты» — это невысокие сапоги или башмаки. Если вторая часть восходит к этому слову, то прозвище мог получить сапожник, изготавливавший такую обувь, или просто человек, который её носил. Соединив оба корня, получаем, что Конокотом могли называть игрока, картежника, шулера (человека, который «конает» и хитрит, как «кот»), либо того же торговца. Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Конокотина, то есть потомок Конокота. Встречается и вариант Конокоткина — это, скорее всего, результат диалектного или бытового искажения, когда корень «кот» получил дополнительный суффикс -к- перед окончанием. Оба варианта редки и несут в себе память о прозвище, которое могло описывать и характер человека, и его ремесло.