Фамилия Коняшкина образована от прозвища Коняшка. В старину это прозвище было весьма распространено, и его значение напрямую связано с лошадью — конём. Коняшкой могли назвать человека, который ухаживал за лошадьми, был конюхом, либо того, кто по характеру или внешности напоминал это животное: был сильным, выносливым, работящим, а иногда и упрямым. В некоторых говорах «коняшкой» называли и маленькую лошадку, пони, что могло указывать на невысокий рост человека.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе Коняш- добавляется суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?» — сын Коняшки). Окончание -а — это грамматическая форма женского рода, но сама фамилия могла передаваться по мужской линии: сначала как Коняшкин, а затем, при передаче по женской линии или в документах, закрепилась форма Коняшкина.

Интересно, что прозвище Коняшка могло быть не только профессиональным, но и охранительным. В крестьянской среде детям иногда давали «лошадиные» прозвища, чтобы обмануть нечистую силу: считалось, что злые духи не позарятся на ребёнка с таким грубым, «животным» именем. Таким образом, фамилия Коняшкина может хранить память о древних народных верованиях.

В отличие от более частых фамилий на -ов (Конев, Конов), форма на -ин (Коняшкин) характерна для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Это типично для северных и центральных регионов России, где такие модели были особенно распространены. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, происходят из одной или нескольких ветвей, разошедшихся по разным губерниям. Точной географии бытования без специальных исследований не установить, но можно предположить, что корни семьи — в областях, где было развито коневодство или где лошадь играла ключевую роль в хозяйстве.