Фамилия Коочкин — редкий случай, когда написание почти не скрывает исходного звучания, но при этом ставит в тупик любого, кто пытается угадать корень. Сразу слышится что-то вроде «коочка» или «кочка», и это верная догадка: фамилия образована от прозвища или мирского имени Коочка. В русских говорах «коочка» — диалектный вариант слова «кочка», то есть бугорок на болоте или неровность на дороге. Прозвище Коочка могли дать человеку невысокого роста, коренастому, либо тому, кто жил у кочкарника — болотистой местности, покрытой кочками.

Словообразовательная модель здесь простая и архаичная: суффикс -ин указывает на принадлежность. Коочкин буквально значит «сын Коочки» или «человек из рода Коочки». Это типичная «посессивная» фамилия, как Кузьмин или Ильин, но с неканонической, прозвищной основой. Интересно, что в некоторых регионах «коочка» могло быть не только топографическим прозвищем, но и уменьшительной формой от имени Кондратий или Косма (через народные варианты Конон, Коночка), но это менее вероятно: фамилия Коочкин слишком точно совпадает с диалектным словом.

Географически фамилия крайне редкая и, скорее всего, локальная. По данным современных справочников, она встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье — в областях, где болотистый ландшафт был привычным, а прозвища по местности — обычным делом. В центральных и южных регионах она почти не фиксируется. Сословная принадлежность предков — почти наверняка крестьяне или посадские люди: фамилии на -ин от прозвищ редко встречались у дворянства, которое чаще брало фамилии на -ов/-ев от полных церковных имён.

Фамилия Коочкин не имеет отношения к финно-угорским языкам, хотя по звучанию может напоминать карельские или вепсские слова. Это чисто русская, диалектная фамилия, сохранившая в себе живое народное слово, которое почти вышло из употребления.