Фамилия Кошмитко — редкий пример, где сразу бросается в глаза нетипичный для русской ономастики суффикс. Окончание -ко характерно для украинских и белорусских фамилий, но в данном случае оно наложилось на основу, которая звучит не по-славянски. Если отбросить суффикс, остаётся корень Кошмит—, который не имеет очевидных параллелей в восточнославянских языках. Это сразу наводит на мысль о заимствованной основе.

Наиболее вероятное объяснение — фамилия тюркского происхождения. В тюркских языках есть слова, звучащие как «кош» (шалаш, стоянка, кочевье) и «мит» или «мет» (цель, метка, знак). Однако более правдоподобно, что в основе лежит личное имя или прозвище Кошмит, которое могло быть образовано от тюркского «кош» (в значении «пара», «двойня») и аффикса, указывающего на принадлежность. В таком случае Кошмитко — это «потомок Кошмита», а сам Кошмит, возможно, был вторым ребёнком в семье (двойняшкой) или человеком, который жил в коше (временном жилище).

Суффикс -ко в украинской и белорусской традиции часто указывал на молодого человека, сына или ученика. То есть фамилия Кошмитко могла первоначально означать «маленький Кошмит» или «сын Кошмита». Это типичная модель для фамилий на -ко, которые массово возникали в XVI–XVII веках на территории современной Украины и юга Беларуси. Носители фамилии, скорее всего, происходят из западнорусских земель, где славянское население веками контактировало с тюркскими народами (крымские татары, ногайцы, турки). Прозвище могло закрепиться за человеком, который либо сам был выходцем из тюркской среды, либо имел характерную внешность или род занятий, связанных с кочевым бытом.

Встречается также версия, что Кошмитко — это искажённая форма от польского или немецкого имени. Например, от немецкого Kaschmidt (смесь Kaspar и Schmidt) или от польского Kośmider (производное от Kośma, то есть Кузьма). Но это менее убедительно, так как в таком случае фамилия скорее звучала бы как Кошмидт или Кошмидер, а не Кошмитко. Тюркская версия объясняет и редкий корень, и характерный суффикс, и регион бытования.

Сегодня фамилия Кошмитко встречается крайне редко, в основном на западе Украины и среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. Это одна из тех фамилий, которая сохранила в себе отголосок давних этнических контактов между славянами и степными народами.