Фамилия Кострубей образована от аналогичного прозвища, которое было широко распространено в Малороссии. Это прозвище ведет свое начало от слова «коструб», имеющего в переводе с украинского языка несколько значений. Поэтому подобное прозвище мог получить хищный и ловкий человек. Кострубом также именовали весеннюю игру, обрядовые девичьи пляски. В украинских весенних ритуалах Коструба изображало чучело мужчины, которое сжигали. Следовательно, так могли называть ребенка, родившегося в это время, либо веселого человека, плясуна. Еще одно значение слова «коструб» – «неряха, грязнуля». В этом случае прозвище, легшее в основу фамилии, указывало на определенные черты характера его обладателя. Так, в Книге памяти Нижегородской области упоминается кондуктор ст. Куйбышев Кострубей Прокопий Матвеевич, родившийся в 1892 году в селе Стрельники Винницкой области на Украине.