Фамилия Котмакова — женская форма фамилии Котмаков, и её происхождение стоит искать не в очевидном «кот», а в более редкой основе. Словообразовательная модель здесь проста: суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Котмаков — потомок человека по прозвищу или имени Котмак.

Самое правдоподобное объяснение корня «Котмак» — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) «кот» означает «счастье», «благодать», а «мак» — аффикс, образующий имя или прозвище. Таким образом, Котмак — это «счастливчик», «благословенный» или «тот, кто приносит удачу». Такие имена были распространены у народов Поволжья и Приуралья, где русские фамилии нередко возникали на стыке культур. Предки Котмаковых вполне могли быть выходцами из татарской или башкирской среды, принявшими православие, либо русскими, перенявшими прозвище от соседей.

Версия о связи с русским словом «кот» маловероятна. Суффикс -мак нехарактерен для русской антропонимии: если бы прозвище было связано с котом, оно звучало бы как Котов, Кошкин или Котя. Исключение — редкое диалектное слово «котмак» (например, в некоторых говорах так называли вид рыбы или нечто скрюченное), но документальных подтверждений этому мало, и тюркская версия выглядит убедительнее.

Географически фамилия Котмакова встречается в основном в регионах с исторически смешанным русско-тюркским населением: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это косвенно подтверждает тюркскую основу. В центральной России фамилия редка, что делает её хорошим маркером восточного или юго-восточного происхождения рода.

Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казачьей — в этих средах прозвища и имена из тюркских языков приживались легче, чем в дворянской среде, ориентированной на греко-византийские календарные имена. Точных данных о древности фамилии нет, но по модели образования (на -ов) она сформировалась не позднее XVII–XVIII веков, когда шла активная фиксация фамилий у податных сословий.

Таким образом, Котмакова — фамилия с тюркским корнем, означавшая «счастливый человек» или «благословенный». Носительницы этой фамилии могут с большой вероятностью связать свои корни с Волго-Уральским регионом и культурным обменом между русскими и тюркскими народами.