Фамилия Ковбоша — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно в первую очередь посмотреть на суффикс. Окончание -а в именительном падеже (Ковбоша, а не Ковбош) указывает на то, что перед нами не типичная русская фамилия на -ов/-ев или -ин. Скорее всего, это фамилия украинского или белорусского происхождения, где суффикс -а характерен для прозвищных фамилий, образованных от личных имён или профессий. В русском языке такие фамилии часто склоняются как существительные женского рода, но принадлежат мужчинам.

Основа фамилии — «Ковб-» — сразу отсылает к слову «ковбаса» (колбаса). В украинском и южнорусских говорах «ковбаса» — это не только продукт, но и распространённое прозвище. Прозвище Ковбаса могли дать колбаснику, мяснику, торговцу, а также человеку с плотной, коренастой фигурой или, напротив, очень худому (по иронии). Форма «Ковбоша» — это, вероятно, уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный вариант от «Ковбаса» через суффикс -ош-. Такая модель образования типична для украинских фамилий: Степан — Степоша, Гриць — Грицоша. То есть предка могли звать Ковбошей, а его дети стали Ковбошами.

Существует и другая, менее вероятная версия. В польском языке есть слово «kobuz» (пустельга, вид сокола), а также фамилия Kobuz. Если учесть, что фамилия могла прийти с западноукраинских или польских земель, то «Ковбоша» могла быть искажением от «Кобуша» — через озвончение глухого согласного. Однако связь с «ковбасой» куда прозрачнее и логичнее: такая основа встречается в украинских фамилиях Ковбаса, Ковбасюк, Ковбасенко, и Ковбоша вписывается в этот ряд как уменьшительная форма.

Географически фамилия Ковбоша, судя по редким упоминаниям, тяготеет к западным областям Украины (Волынь, Подолье) и, возможно, к Беларуси. В дореволюционных метрических книгах её можно встретить среди мещан и крестьян — сословий, где прозвища были особенно живучи. Социальный контекст прост: предок, скорее всего, был ремесленником или торговцем, связанным с мясным делом, либо получил прозвище по внешнему признаку. Фамилия не дворянская и не духовная, её носители — люди из народа, что и объясняет её редкость и отсутствие в официальных родословных книгах.