Фамилия Ковчуго — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить интуитивное желание связать её с ковчегом, придётся копнуть глубже в украинскую и южнорусскую диалектную лексику. Основа здесь — не «ковчег», а слово «ковчуга», которое в некоторых говорах означало «кольчуга» (доспех из металлических колец). Чередование «ч» и «л» в данном случае неслучайно: это результат древнего фонетического процесса, когда в одних диалектах «кольчуга» превратилась в «ковчугу» под влиянием глагола «ковать» (кованая рубаха). Таким образом, Ковчуго — это прозвище мастера, который делал кольчуги, либо воина, который их постоянно носил.

Обратите внимание на окончание -о. Это характерный признак украинских фамилий, образованных от прозвищ с помощью суффикса -уг-/-юг- (ср. Бондарчук, Кравчук, но с усечением). В украинской ономастике модель «основа + -о» часто даёт фамилии без дополнительного патронимического суффикса: Ковчуго — буквально «тот, кто имеет отношение к ковчуге». На русской почве такие фамилии обычно русифицировали, добавляя -ов (Ковчугов), но форма Ковчуго сохранилась как архаичная, возможно, у потомков выходцев с Левобережной Украины или из южнорусских областей, где украинское влияние было сильным.

Есть и вторая, менее вероятная версия. В некоторых польских и белорусских говорах «ковчуга» — это разновидность сундука или ларца (от того же корня, что и «ковчег»). Тогда прозвище мог получить сундучник или просто запасливый, бережливый человек. Но первая версия — с кольчугой — выглядит убедительнее: военная лексика чаще давала устойчивые прозвища, чем бытовая утварь, и к тому же лучше объясняет географию фамилии (она встречается в основном на юге России и в восточных областях Украины).

Сословная принадлежность носителей фамилии Ковчуго, скорее всего, была разнородной. Среди казачества и однодворцев (потомков служилых людей) такие «профессиональные» прозвища были нормой. В ревизских сказках XIX века эта фамилия могла записываться как Ковчуга или Ковчюга, а окончание -о закрепилось уже в советских паспортах при унификации написания. Если у вас сохранились семейные предания о предке-кузнеце или оружейнике, они вполне могут быть правдивы.