Фамилия Козеевская образована от мужского прозвища или имени Козей — через стандартную модель с суффиксом -ев- и окончанием -ская, характерную для дворянских и шляхетских фамилий в Речи Посполитой и на западнорусских землях. Суффикс -ская (женский вариант от -ский) указывает на принадлежность к местности или роду: Козеевский — тот, кто из владений или семьи Козея. Сама основа «Козей» — это уменьшительная форма от имени Козьма (Кузьма) или напрямую от слова «козёл» в прозвищном значении.

В ономастике прозвища, связанные с козлом, нередки. Козлом в старину называли упрямого, бойкого или «скачущего» человека, а также того, кто пас коз или имел с ними дело. Однако форма Козей, а не Козёл, говорит скорее о ласкательном или фамильярном варианте — как Козлик, Козля. В белорусских и украинских говорах «козей» могло означать «козий» (принадлежащий козе), но как личное прозвище это маловероятно.

Фамилия Козеевская — редкая, с выраженной географической привязкой к восточным землям бывшей Речи Посполитой (современные Беларусь, Украина, запад России). Окончание -ская типично для польской и украинской шляхты, но не обязательно указывает на благородное происхождение: в XIX веке такие фамилии могли получить крестьяне и мещане при переходе в православие или при записи в ревизские сказки. Аналог по модели — фамилии Козеев, Козеевский, Козеенко.

Версия о происхождении от тюркского корня (например, «козей» — защитник) не подкреплена источниками и выглядит натянутой, так как суффикс -ев- и -ская однозначно указывают на славянскую словообразовательную основу. Более правдоподобно, что предок носителя фамилии носил прозвище Козей, а его потомки, переселившись или получив землю, стали Козеевскими.