Фамилия Козеева — это отчество, образованное от прозвища или мирского имени Козей. Самая прямая версия связывает его с украинским словом «козій», то есть «козий», «относящийся к козе». Так могли прозвать человека, который пас или разводил коз. В этом случае фамилия — отголосок занятия предка, его повседневного дела.

Есть и другая, не менее распространённая в русской ономастике версия. Козей могло быть уменьшительной формой от древнего мирского имени Коза. Наши предки часто давали детям «защитные» имена по названиям животных, чтобы обмануть недобрые силы или, наоборот, передать ребёнку качества зверя. Коза в народной культуре — символ плодовитости, здоровья и жизненной силы. Называя сына Козой, родители желали ему именно этих свойств.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: сначала было имя или прозвище Коза. От него образовалась патронимическая (отцовская) форма Козей — «сын Козы». Затем, по стандартной для русского языка схеме, от имени Козей возникла фамилия Козеев (чей? — Козеев сын), а её женский вариант — Козеева. По сути, это отчество второго порядка: внук Козы.

Суффикс -еев указывает на основу, оканчивающуюся на -ей (Козей → Козеев). Такая модель характерна для фамилий, сложившихся в центральных и южнорусских областях, где было сильно влияние украинской и белорусской речи. Встречаются однокоренные фамилии Козин, Козлов, Козеев — все они восходят к одному и тому же животному, но через разные прозвищные формы.