Фамилия Козубековы (в мужском варианте — Козубеков) — один из тех родовых имен, чью историю нужно начинать с разбора самого имени, а не с географии или сословия. В основе лежит мужское личное имя Козубек. Вопреки возможному предположению, оно не связано напрямую с русским словом «козёл» или украинским «козуб» (корзина). Это восточное, тюркское имя, и его модель образования типична для народов, исповедующих ислам.

Скорее всего, Козубек — это фонетический вариант имени Казбек (или Казибек). В тюркских языках гласные первого слога могли меняться: «а» переходило в «о» под влиянием местных говоров. Имя Казбек составное: первая часть восходит к арабскому «кази» (قاضي) — «судья», вторая — тюркское «бек» (bey, beg) — «господин, князь, хозяин». Целиком имя Казибек означает «господин-судья» или, с учётом религиозного контекста, «судья, воюющий за веру». Имя Казбек давали мальчикам в мусульманских семьях, желая им справедливости, силы и достоинства.

Фамилию Козубеков образовали по стандартной русской модели: к основе имени Козубек добавили патронимический суффикс -ов. Он указывает на принадлежность: «сын Козубека» или «из рода Козубека». Так, в XIX–XX веках, при оформлении паспортов и метрик, у оседлых тюркских народов (татар, башкир, ногайцев, казахов) и появилась эта фамилия.

Интересная деталь: в отличие от многих «княжеских» фамилий на -беков (например, Темирбеков, Алибеков), где вторая часть имени очевидна, вариант Козубек встречается реже. Возможно, это локальная форма, закрепившаяся в конкретном селе или у определённого рода. Точное время и место возникновения фамилии без генеалогического поиска не установить, но её структура ясно говорит: перед нами памятник восточной антропонимии, вписавшийся в русскую фамильную систему.