Фамилия Козявкина — один из тех случаев, когда прозвище, данное человеку, закрепилось за его потомками, не утратив своей выразительности. В основе лежит слово «козявка». В современном языке у него два основных значения: мелкое насекомое (букашка) и, в переносном смысле, нечто маленькое, незначительное или капризный, приставучий человек (часто по отношению к детям). Именно второе, переносное значение, скорее всего, и стало источником прозвища.

Слово «козявка» — исконно русское, родственное диалектным «козюля» (змея, гадюка) и «козявый» (нечистый, пакостный). В старину так могли назвать невысокого, юркого человека, либо того, кто постоянно «лезет» с разговорами или делами. Прозвище носило скорее бытовой, насмешливый, но не обязательно оскорбительный характер — в деревнях такие «домашние» имена давали без злого умысла, по внешности или поведению.

Фамилия образована по типичной русской модели: от прозвища Козявка через суффикс принадлежности -ин. Суффикс -ин указывает на то, что основатель рода — человек из семьи Козявки: «чей?» — «Козявкин сын». Форма Козявкина — это женский вариант фамилии или указание на принадлежность к роду (жена или дочь Козявкина).

Интересно, что фамилия Козявкин (и её женская форма) встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях. В этих краях диалектные слова с корнем «коз-» (козюля, козявка) были особенно распространены. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды — в дворянских родах такие «натуралистичные» прозвища почти не встречались.

В ономастике фамилию Козявкина обычно не путают с фамилией Козявкин, образованной от «козявый» (неопрятный, грязный) — это разные корни, хотя и звучат похоже. Версия о происхождении от насекомого («букашка») менее вероятна: в русской антропонимии прозвища по насекомым встречаются, но реже, чем по чертам характера или внешности. Поэтому основным значением фамилии стоит считать указание на человека маленького роста или с «назойливым» характером.