Фамилия Козюбра — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка сохранилось в неизменном виде. В ней нет типичных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский, которые перерабатывали бы имя в притяжательную форму. Перед нами чистая основа, застывшая в именительном падеже. Такое оформление характерно для украинских, белорусских и южнорусских фамилий, где прозвища часто переходили в фамилии без дополнительных приращений.

Корень слова — «козюбр» — в славянских говорах имеет два основных значения. Первое и наиболее вероятное: диалектное название корзины, кузова или плетёной заплечной ноши. В украинском языке «козуб» или «козюб» — это именно корзина, чаще всего для сбора грибов, ягод или переноски сена. Второе значение, зафиксированное в некоторых русских говорах, — неуклюжий, нерасторопный человек, увалень. Учитывая, что прозвища по предметам быта в крестьянской среде были обычным делом (Корзина, Лопата, Ведро), версия с «корзинщиком» или человеком, постоянно носившим с собой кузов, выглядит предпочтительнее. Прозвище «Неуклюжий» тоже возможно, но оно менее конкретно и реже становилось основой для фамилий без суффикса.

Интересна фонетическая деталь: в слове «Козюбра» появился вставной звук «р». Это типичный для восточнославянских диалектов процесс эпентезы, когда между гласными или на стыке морфем возникает дополнительный согласный для удобства произношения. Сравните с диалектными «скрупулёзный» (из «скрупулёзный») или «друшлаг» (из «дуршлаг»). То есть исходная форма могла звучать как «Козюба» или «Козуб», а со временем в речи закрепился вариант «Козюбра».

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям, особенно к Черниговской, Гомельской и Брянской областям. По данным современных исследований, основная масса носителей Козюбра сосредоточена именно там. Это косвенно подтверждает украинское происхождение корня: в центральной России чаще встречаются формы «Козубов» или «Козубин», а здесь прозвище сохранилось без изменений, как и требовали местные ономастические традиции.

Таким образом, предок носителя фамилии Козюбра, скорее всего, был либо корзинщиком-плетельщиком, либо человеком, которого в деревне прозвали за любовь к походам в лес с большим кузовом. Менее вероятно, но не исключено, что прозвище дали за медлительность или неповоротливость, сравнив с мешковатой ношей.