Фамилия Крапцов — пример редкой словообразовательной модели, где основа усекается, а суффикс -ов присоединяется прямо к корню. В большинстве русских фамилий на -ов мы видим полную основу: Кузнец — Кузнецов, Плотник — Плотников. Здесь же исходное слово «крапец» (или «крапчик») потеряло конечный элемент, и получилось Крапцов, а не ожидаемое Крапецов или Крапчиков. Такое усечение встречается, но нечасто, и сразу указывает на то, что фамилия формировалась в устной, а не в письменной среде, где форму закрепили так, как произносили.

Корень «крап-» ведет к двум основным версиям, и обе имеют под собой реальную почву. Первая — от глагола «крапать» в значении «капать, сеять мелко, сыпать». В старых говорах «крапать» могло означать и «делать крапинки», и «моросить». Прозвище Крапец могли дать либо человеку с рябым, в мелких веснушках лицом, либо тому, кто занимался кропотливым делом — например, наносил узор крапинками на ткань или посуду. Вторая версия — от «крапива»: в диалектах встречается форма «крапива» с утратой гласного, и «крапец» могло быть прозвищем человека, жившего у зарослей крапивы или имевшего колючий, «жалящий» характер.

В ономастических справочниках фамилия Крапцов не числится среди массовых. Она не попала в сводки Б. Унбегауна или В. Никонова как типичная для какого-либо региона, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, она возникла в северных или центральных губерниях России, где диалектное слово «крапец» было в ходу. Сословно носители могли быть крестьянами или посадскими людьми — прозвища такого типа редко давали дворянам, которые чаще получали фамилии от географических названий или вотчин.

Интересно, что фамилия могла писаться и через «б» — Крабцов, если в основе лежало слово «краб» (в русских говорах так называли рака или мелкое ракообразное). Но это менее вероятно: для прозвища «Крабец» географическая привязка к морю или крупным рекам была бы обязательна, а Крапцов встречается и в глубине материковой России. Современные носители фамилии рассеяны по стране, но заметного скопления нигде не образуют — это типичная «одиночная» фамилия, сохранившаяся в нескольких ветвях рода.