Фамилия Крестенкова — женская форма фамилии Крестенков, которая относится к группе славянских фамилий, образованных по модели «основа + суффикс -енк(ов)». Эта модель особенно характерна для украинской, белорусской и южнорусской ономастики. Суффикс -енко традиционно указывал на потомка или принадлежность к кому-либо: в украинской среде он присоединялся напрямую к основе (Крестенко), а при адаптации в великорусской системе фамилий к нему добавили типичный русский суффикс -ов, получив Крестенков. Таким образом, носитель фамилии — потомок человека, которого в основе звали Крест или Крестен.

В основе фамилии лежит слово «крест». Сразу напрашивается версия о связи с христианским именем Крест — в православных святцах такого имени нет, но в народной среде могли использовать прозвище или мирское имя Крест, данное, например, ребенку, родившемуся на Крещение или в Крестопоклонную неделю. Более вероятно, что исходным было прозвище Крест (или уменьшительное Крестен), которое давали человеку, носившему нательный крест особой формы, либо тому, кто изготавливал кресты (резчику, кузнецу). В южнорусских и украинских говорах «крестен» могло означать «крестник» (восприемник при крещении), и тогда фамилия указывает на родство по крещению: Крестенков — сын крестного отца или того, кого крестили.

Словообразовательная цепочка выглядит так: Крест → Крестен(ко) (уменьшительное или отчество на -енко) → Крестенков (русифицированная форма с патронимическим суффиксом -ов). В этом смысле фамилия Крестенкова — двойной патроним: она буквально означает «дочь Крестенкова», то есть «внучка Крестенка» или «правнучка Креста».

Интересно, что фамилии с корнем «крест» в русской среде встречаются не так часто, как можно было бы ожидать, учитывая центральную роль креста в православии. Это объясняется тем, что церковь долго не поощряла использование сакральной символики в мирских прозвищах. Тем не менее, в польской ономастике известна фамилия Кшестовский (от krzyż — крест), в украинской — Хрестенко, Хрестин. Русская Крестенкова стоит в одном ряду с фамилиями Крестов, Крестинский, Крестников, но отличается от них именно суффиксом -енк(ов), выдающим южное или западнорусское происхождение.

В дореволюционной России фамилия Крестенкова могла принадлежать как крестьянам или мещанам, так и духовенству — в среде священнослужителей нередко давали «говорящие» фамилии, образованные от церковных понятий. Однако без генеалогического исследования сказать точно о сословной принадлежности конкретной ветви нельзя. Географически фамилия тяготеет к регионам, где бытовала модель на -енко: Черниговщина, Полтавщина, Курская, Воронежская и Ростовская губернии.