Фамилия Криштапенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, самой распространённой в этой ономастической традиции. Суффикс -енко исторически означал «маленький», «сын», «потомок», а впоследствии закрепился как фамильный. Поэтому Криштапенко — это «сын Криштапа» или «потомок Криштапа».

Основа фамилии — прозвище Криштап. Это украинская фонетическая форма имени Христофор (греч. Χριστόφορος — «несущий Христа»). В украинском языке начальное «х» часто переходило в «к», а «ф» — в «п» (сравните: Хома — укр. Хома, но в фамилиях встречается и Криштап, и Христофоренко). Второй вариант происхождения — от слова кришталь (хрусталь). В таком случае прозвище Криштап могли дать стеклодуву, торговцу посудой или человеку с прозрачными, «хрустальными» глазами. Однако первая версия (от Христофора) более правдоподобна: имя-основа даёт фамилию напрямую, без переосмысления через профессию.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины (Полтавщина, Черкащина, Киевщина), где суффикс -енко вытеснил другие модели. В России Криштапенко встречается реже и обычно у потомков переселенцев конца XIX — начала XX века.

С точки зрения социальной истории, Криштапенко — фамилия крестьянская и казацкая. В реестрах Запорожского войска и метрических книгах Гетманщины такие фамилии на -енко носили преимущественно свободные люди, а не крепостные. Это не говорит о знатности, но указывает на принадлежность к слою, имевшему личную свободу.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые «застывали» в форме прилагательного (Криштапов), модель на -енко оставалась неизменяемой по родам и числам. Поэтому женщина-Криштапенко не меняет фамилию при замужестве — это наследие той же словообразовательной логики.