Фамилия Криштапович — один из тех случаев, когда написание и произношение уводят в разные стороны. В ней отчётливо слышен польско-белорусский след, и начинать её разбор стоит не с корня, а с суффикса. Формант -ович — классический для восточнославянских фамилий знак патронимии: он буквально отвечает на вопрос «чей сын?». В Польше и Великом княжестве Литовском такие фамилии на -ович носили в основном шляхта и мещане, а в Московском государстве они долго считались «непростыми» и указывали на происхождение из западнорусских земель.

Самая правдоподобная версия связывает основу Криштап- с мужским именем Криштоп. Это западнославянский вариант имени Христофор, что значит «несущий Христа» или «несущий крест». В народной этимологии имя переосмыслили, сблизив с польским krzyż — «крест». Святой Криштоп (Христофор) почитается как покровитель путешественников, так что имя было распространённым и давалось в надежде на защиту в дороге. Имя давало прозвище, а от него — фамилию: Криштапович — «сын Криштапа».

Менее вероятная, но не лишённая оснований версия выводит фамилию из белорусского крышталь — «кристалл, хрусталь». В таком случае прозвище Криштап мог получить ювелир, стеклодув или торговец хрустальной посудой. Однако эта гипотеза слабее: для фамилий на -ович характерна связь с личным именем, а не с ремеслом, и звуковое совпадение здесь скорее случайное.

Отдельного внимания заслуживает связь с дворянским родом Криштафовичей. Выходцы из Польши, они упоминаются в русских документах с середины XVII века: Дементий Иванович Криштафович служил стольником (1662–1684), его сын Илья — стряпчим (1685). Род внесён в VI часть родословной книги Смоленской губернии. Разница в написании — Криштафович и Криштапович — объясняется просто: в польском языке звук [ф] часто переходил в [п] в народном произношении, а фамилия записывалась на слух. Так что Криштаповичи и Криштафовичи — скорее всего, ветви одного корня.