Фамилия Крупчеко — яркий пример украинской модели фамильного суффикса -енко, который в классическом виде означает «маленький», «сын» или «потомок». В украинской ономастике это самый распространённый патронимический суффикс, и Крупчеко, скорее всего, означает «сын Крупка» или «потомок Крупки». Основа здесь — не полное имя, а прозвище или уменьшительная форма.

Корень «Круп-» отсылает к слову «крупа». В прямом смысле прозвище Крупка могли дать человеку, который торговал крупой, молол её на мельнице или просто был мелким, «крупитчатым» — невысоким, щуплым. Но есть и другая, не менее правдоподобная версия: в диалектах «крупка» могла означать «крошка», «малыш» — так могли назвать младшего ребёнка в семье. В таком случае фамилия Крупчеко — это «сын того, кого звали Малышом».

Интересно, что суффикс -ченко (а Крупчеко — это именно форма с -ченко, а не -енко) часто указывает на основу, оканчивающуюся на -к. То есть исходное прозвище было именно Крупка, а не Круп. Фонетически это абсолютно естественно для украинской речи: Крупка → Крупченко → со временем, под влиянием живого произношения или при записи, могло закрепиться как Крупчеко. Такая замена «ч» на «ч» не меняет смысла, но отличает фамилию от более частого варианта Крупченко.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине — регионам, где фамилии на -енко исторически доминировали. В России она встречается реже и часто воспринимается как украинская по происхождению. Сословно носители фамилии, скорее всего, были казаками или крестьянами: прозвища, связанные с ремеслом или внешностью, типичны для непривилегированных слоёв, а патронимическая форма на -енко в XVII–XVIII веках была массовой именно в казацкой среде.