Фамилия Крупчински звучит как типичная польская или белорусская фамилия. Её основа — «Крупчин» — восходит к слову «крупка» или «крупа». В славянских языках так называли мелкое зерно или крупу, а в переносном смысле — человека, который торговал крупой или был мелким, щуплым. Суффикс «-ски» (польск. -ski) указывает на дворянское или шляхетское происхождение: в Польше и Великом княжестве Литовском такие фамилии носили владельцы поместий с названием Крупчин или Крупчицы. Однако в народной среде фамилии на «-ский» могли давать и крестьянам по названию деревни, где они жили.

Наиболее вероятно, что предок носителя фамилии происходил из местечка Крупчицы (современная Беларусь, Брестская область) или из села Крупчин на территории Польши. В этом случае фамилия — топонимическая, то есть образована от названия места жительства. Менее распространённая версия: прозвище Крупча или Крупчин давали человеку, который занимался изготовлением или продажей крупы, а затем к прозвищу добавили шляхетский суффикс.

В написании «Крупчински» (а не «Крупчинский») видно влияние польской орфографии, где окончание -ski не русифицируется. В русской традиции фамилия часто трансформировалась в Крупчинский. Встречается также вариант Крупчинская для женщин.

Фамилия редкая, её носители в основном сосредоточены в западных регионах Беларуси и восточной Польше. В России она практически не встречается, что подтверждает её узкую географическую привязку к исторической территории Речи Посполитой.