Фамилия Крупицын — один из ярких примеров того, как русская фамилия может быть образована от прозвища, связанного с внешностью или характером, а не с профессией. В основе лежит слово «крупица» — уменьшительная форма от «крупа». Однако вряд ли предок был торговцем крупой: прозвище Крупица в старину давали человеку мелкого, невысокого роста, «с крупинку», или же тому, кто был мелочным, придирчивым, «перебирал по крупицам». В говорах слово «крупица» могло также означать веснушку или родинку — тогда прозвище указывало на рябого или веснушчатого человека.

Суффикс -ын указывает на принадлежность: Крупицын — это «сын Крупицы» или «человек из семьи Крупицы». По модели образования фамилия типична для северных и центральных областей России, где патронимические формы на -ин/-ын особенно распространены. В южных и западных регионах чаще встречается вариант Крупицкий, образованный через польско-украинский суффикс.

Интересно, что фамилия Крупицын — сравнительно редкая. В дореволюционных справочниках она встречается в основном среди крестьян и мещан Вятской, Костромской и Вологодской губерний. Это косвенно подтверждает версию о прозвищном, а не профессиональном происхождении: в этих краях ремесло крупяника не было настолько массовым, чтобы породить десятки однофамильцев.

В отличие от фамилий Крупин или Крупенин, которые могли возникнуть от топонимов (названий сел Крупино), Крупицын прочно держится за прозвище. Спорной можно считать версию о связи с церковным именем Круп (от греческого «скрытый»), но она не находит поддержки в ономастической литературе — слишком редкое и нехарактерное для русской традиции имя.