Фамилия Крушенков — редкий пример, когда за основу взяли не имя, а растение. В её центре — мирское имя или прозвище Крушенок, которое напрямую связано с кустарником крушиной. Крушина известна ломкими ветвями и корой, которую с давних пор использовали в народной медицине как слабительное. Давая ребёнку имя Крушенок, родители следовали древней традиции: природа должна была признать малыша «своим» и передать ему свои качества — скорее всего, выносливость и жизненную силу, а не лекарственные свойства.

Вероятно, прозвище Крушенок закрепилось за человеком, который жил в зарослях крушины, торговал её корой или лечил ею. Такое прозвище — типичный пример того, как окружающая среда становилась частью фамильного имени.

Есть и другая, менее очевидная версия. Польское слово «kruszec» означает «руда». Если предок носителя фамилии был рудокопом или занимался добычей металла, прозвище Крушенок могло указывать на его профессию. Эта гипотеза правдоподобна, если учесть, что фамилии на -енков часто встречаются в западных и южных регионах, где были развиты горные промыслы.

Сама фамилия образована по типичной восточнославянской модели: к основе Крушенок добавили суффикс -ов, который в данном случае указывает на принадлежность («чей?» — Крушенков). Суффикс -енок в основе — уменьшительная форма, характерная для имён и прозвищ в XVI–XVII веках. Со временем такие «полуимена» застыли в фамилиях, и Крушенков — один из примеров этой модели.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и северо-западных областях России. Сословных ограничений у неё не было: Крушенковыми могли быть и крестьяне, и мещане, и духовенство — точных данных, кто именно первым получил эту фамилию, не сохранилось.