Фамилия Кряккиев — редкая, и это сразу наводит на мысль, что её происхождение связано не с массовой моделью образования, а с конкретным, возможно, единичным прозвищем. Самая очевидная версия — звукоподражательная основа. «Крякать» в русском языке — это характерный звук, который издают утки. Прозвище Крякка могли дать человеку с хрипловатым, «утробистым» голосом или с манерой говорить отрывисто, будто «крякая». В русских говорах слово «кряк» могло означать и просто «крик», «шум», так что прозвище могло относиться к шумливому или сварливому человеку.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа «Крякк-» (с удвоенной согласной, что характерно для экспрессивных, подражательных прозвищ) и фамильный суффикс -ев. По правилам русской ономастики, суффикс -ев присоединяется к основам на мягкий согласный или шипящий, а также к основам на -й. В данном случае фамилия звучит так, будто исходное прозвище было Крякка или Кряккей. Если прозвище было Крякка (женского рода, по аналогии с прозвищами вроде Шишка, Коротка), то фамилия образована по патронимическому принципу «чей?» — сын Крякки.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками, где корень «кряк» или «керек» означает «нужный», «потребный». Однако в таком случае фамилия обычно писалась бы через «е» (Керекеев) или имела бы другой суффикс. Учитывая, что удвоенное «кк» — характерный признак русских звукоподражательных и экспрессивных прозвищ (ср. Кваккин, Хрюккин, Чавккин), версия с уткой или хриплым голосом выглядит убедительнее всего.

Фамилия почти наверняка не дворянская и не книжная. Скорее всего, она возникла в крестьянской или мещанской среде, где прозвища давали метко, по внешнему признаку или поведению. Единичные случаи бытования фамилии Кряккиев встречаются в центральных и северных областях России, но массовой географии у неё нет. Это фамилия, которая могла остаться в одном роду и не распространиться шире, что делает её уникальным маркером для потомков.