Фамилия Крянина образована по типичной для русского севера и центра модель с суффиксом -ин. Он указывает на принадлежность: Крянина — «дочь (или жена) Кряни», а в основе лежит прозвище или нецерковное имя Кряня. Такие именования, по той же модели, широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян.

Корень кря- в русских говорах многозначен. Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «кряж» — так называли низкорослый лес, крепкий пень или, в переносном смысле, коренастого, плотного человека. Прозвище Кряня могли дать человеку невысокого роста, но крепкого сложения, «сбитого». Менее распространённая гипотеза выводит основу от глагола «крякать» (как утка) — такое прозвище могло закрепиться за человеком с хрипловатым или отрывистым голосом.

Славянские фамилии возникали от личного прозвища или от имени (христианского или языческого). В случае с Кряниной мы имеем дело именно с прозвищным именованием, которое со временем закрепилось как родовое. Интересно, что фамилия практически не встречается в формах на -ов/-ев, что типично для прозвищ, оканчивающихся на мягкий согласный или -а/-я. Географически фамилия тяготеет к северным областям России — Архангельской, Вологодской, Кировской, где диалектное слово «кряж» было особенно употребительно. Сравните с однокоренными фамилиями Кряжев, Кряжов — они образованы от той же основы, но с другим суффиксом, что говорит о разных региональных традициях оформления прозвищ.

Таким образом, предок носителей фамилии Крянина, скорее всего, был крепким, невысоким человеком из северорусских земель, а сама фамилия сохранила в себе народное слово, вышедшее из активного употребления в литературном языке.