Фамилия Крянникова происходит от прозвища Крянник. Его основа — диалектный глагол «крянуть», который в Новгородской, Тверской и Вятской губерниях означал «трогать, двигать, сдвигать, столкнуть с места». Эта редкая глагольная форма, почти не встречающаяся в литературном языке, и определила редкость самой фамилии.

Скорее всего, прозвище Крянник относилось к «профессиональным» именованиям. Так могли назвать грузчика или строителя — человека, чья работа связана с перемещением тяжестей, сдвиганием с места брёвен, камней или мешков. Но есть и другая версия: прозвище могло указывать на характер. Крянником называли человека упорного, настойчивого, которого трудно сдвинуть с принятого решения, или, напротив, нетерпеливого, постоянно «сдвигающегося» с места.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Крянник добавился патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Крянника). Со временем окончание -а в женском роде закрепилось как формальный признак фамилии, не меняющий её смысла. Таким образом, Крянникова — это прямая родовая отсылка к предку, которого в округе знали под прозвищем Крянник.