Фамилия Крыхтин — одна из тех, где за простым звучанием скрывается прозрачная, но не единственная версия происхождения. В её основе лежит нецерковное, мирское имя Крыхта. Наиболее убедительное объяснение ведёт к украинскому слову «крихта», что значит «крошка». Скорее всего, так родители ласково называли маленького ребёнка — уменьшительное имя закреплялось за ним на всю жизнь и переходило к потомкам уже в форме фамилии.

Однако здесь есть и второй смысловой слой. То же самое слово могло стать прозвищем для взрослого человека невысокого роста — «крошка» в прямом, а не в переносном смысле. В русских говорах подобные прозвища по физическим особенностям были обычным делом, и фамилия Крыхтин вполне могла закрепиться за невысоким, коренастым родоначальником. Обе версии не противоречат друг другу: в любом случае, основа — уменьшительная или описательная характеристика человека.

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Крыхтин, то есть сын или потомок Крыхты. Такая модель типична для фамилий, возникших из прозвищ и мирских имён, оканчивающихся на -а.

Среди известных носителей — Михаил Лукич Крыхтин (1923–1999), дальневосточный учёный-ихтиолог, кандидат биологических наук. Он внёс значительный вклад в изучение биологии рыб в бассейне Амура и разработку научных основ рационального промысла. Эта фамилия, таким образом, встречается не только в крестьянской среде, но и в научной династии, что делает её историю более объёмной.