Фамилия Крышиха — яркий пример севернорусской модели фамилий на -их, -ых, которая указывает на принадлежность к роду или дому. В русской ономастике фамилии этого типа (например, Седых, Черных, Косых) означали «из семьи таких-то» или «из дома тех-то». Крышиха — это буквально «из семьи Крыша» или «жена/вдова Крыша». Такие фамилии особенно распространены в Вологодской, Архангельской, Кировской областях, где эта модель сохранилась лучше всего.

Основа фамилии — прозвище Крыш. В XVI–XVII веках прозвища от названий частей избы или хозяйственных построек встречались нередко. Крышой могли назвать человека по разным причинам. Самое прямое объяснение: плотника или кровельщика, который крыл крыши. Но есть и переносный смысл: в говорах «крыша» иногда обозначала защиту, покровительство, поэтому прозвище мог получить человек, который брал под опеку других, или, наоборот, тот, кто умел «крышевать» — прятать, укрывать что-либо.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «крыш» — так в некоторых регионах называли верхнюю часть саней или телеги, то есть прозвище могло относиться к мастеру по изготовлению повозок.

Суффикс -иха в данном случае не уменьшительный, а посессивный, указывающий на жену или вдову. В северных говорах женщину нередко называли по мужу: «Петриха» — жена Петра, «Иваниха» — жена Ивана. Со временем такие именования закреплялись как фамилии для потомков. Таким образом, первая носительница фамилии Крышиха была женой человека по прозвищу Крыш, а её дети уже стали Крышихами.

Фамилия редкая, не встречается в массовых списках дворянских родов, что типично для крестьянского происхождения. В ревизских сказках XIX века её можно найти в северных уездах, но точных данных о конкретных носителях в открытых источниках мало. Однокоренные фамилии — Крышкин, Крышов, Крышков — образованы по другим моделям, что подчёркивает уникальность именно формы на -иха, завязанной на семейный статус и региональную традицию.