Фамилия Ктитарева — женская форма фамилии Ктитарев, и её происхождение напрямую связано с церковной и строительной историей. В основе лежит древнегреческое слово «ктитор» (κτήτωρ), которое в византийской и древнерусской традиции означало основателя, строителя или благоустроителя храма. Ктитором называли человека, на чьи средства возводилась церковь или монастырь, а также того, кто брал на себя заботу о её содержании и ремонте. Таким образом, предок носителя этой фамилии мог быть либо зажиточным жертвователем, либо лицом, непосредственно отвечавшим за строительство и хозяйство при храме.

Модель образования фамилии — суффиксальная, с типичным русским патронимическим суффиксом -ев. Он присоединяется к основе, оканчивающейся на твердый согласный (в данном случае к корню «ктитар» — вариант произношения слова «ктитор» с аканьем). В русском языке слово «ктитор» со временем могло звучать как «ктитарь»: в безударной позиции «о» переходило в «а», а конечное «-ор» под влиянием народной этимологии уподоблялось суффиксу деятеля «-арь» (как в словах «звонарь», «пономарь»). В результате появилось прозвище Ктитарь, от которого и пошла фамилия: Ктитарев — сын Ктитаря.

Географически фамилия редкая и встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, а также в среде старообрядцев. В старообрядческой среде слово «ктитор» сохранило архаичное значение и использовалось для обозначения церковного старосты или попечителя, что делает версию о происхождении из купеческой или мещанской среды особенно правдоподобной. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные образования от названий церковных должностей отмечены как характерные для духовного сословия, но здесь, скорее, мы имеем дело с прозвищем по социальной роли, а не с наследственной фамилией священника.

Интересно, что фамилия Ктитарева — яркий пример того, как греческое книжное слово, попав в народную речь, изменило звучание и обросло типично русскими суффиксами. В ней нет ни географической привязки к конкретному селу, ни указания на крестьянское происхождение — это фамилия, которая говорит о положении человека в церковной общине, о его достатке и уважении. Других, более прозаических версий (от профессии или от личного имени) для этой фамилии не существует, настолько прозрачна её связь с греческим корнем.