Фамилия Кубушка — редкий пример славянской фамилии, сохранившей исходную форму прозвища без типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Такие «неоформленные» фамилии чаще встречаются у украинцев, белорусов и поляков, чем у русских, что может указывать на западно- или южнославянские корни рода. Само прозвище Кубушка образовано от нарицательного «кубышка» — слова с богатым гнездом родственных форм: «кубека», «кубарь», «кубень», «кубуш». Основных версий его происхождения две.

Первая и самая прямая: прозвище описывало телосложение человека. В славянских говорах все эти слова имели значение «полный, пухлый, круглый». Человека с пышными формами могли в шутку назвать Кубушкой — по аналогии с округлым сосудом. В старину полнота не считалась недостатком, скорее — признаком здоровья и достатка, так что прозвище было скорее описательным, чем обидным.

Вторая версия связывает основу с «куб» — перегонным сосудом для вина, который на Руси называли кубом. В этом случае прозвище Кубушка мог получить винодел, самогонщик или торговец хмельными напитками. Такие профессиональные именования нередко закреплялись за ремесленниками, чей товар или инструмент становился их уличным прозвищем.

Какая из версий правдоподобнее? Скорее всего, обе имели место в разных семьях — омонимия прозвищ обычна для русской ономастики. Но стоит заметить: слово «кубышка» в значении «толстяк» было шире распространено в народной речи, чем профессиональный термин «куб». Поэтому прозвище по внешности — более вероятный источник фамилии, хотя исключать ремесленный след нельзя.

Фамилия Кубушка нечастая, её носители встречаются разрозненно, без ярко выраженного регионального гнезда. В официальных документах XIX века её могли записать и как Кубышка, и как Кубушка — написание не устоялось до советской паспортизации. Однокоренные фамилии — Кубышкин, Кубарев, Кубов — показывают, насколько разнообразно славяне обыгрывали один и тот же корень, добавляя к нему разные суффиксы. Кубушка осталась в самой архаичной, бессуффиксной форме.