Фамилия Кубылина — женская форма фамилии Кубылин, и ключ к её разгадке лежит не столько в корне, сколько в суффиксе. Модель на -ин (Кубыл-ин) в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — сын Кубылы, жена Кубылина. Основа же «Кубыл-» — это прозвище или неканоническое личное имя, которое, скорее всего, связано с диалектным словом «кубыла». В русских говорах, особенно в северных и сибирских, «кубыла» — это кобыла, лошадь. Но есть и более узкое значение: в некоторых регионах так называли неуклюжую, рослую женщину или, наоборот, ленивого, неповоротливого мужчину.

Вероятнее всего, прозвище Кубыла дали человеку, который либо работал с лошадьми (конюх, пастух, извозчик), либо напоминал их повадками — был сильным, крупным или упрямым. В древнерусской антропонимике прозвища от названий животных были обычным делом, и «Кубыла» стоит в одном ряду с фамилиями Кобылин, Жеребцов, Лошаков. Интересно, что в некоторых говорах «кубыла» означала также «клубок» или «моток ниток», но это значение — более редкое и локальное, и вряд ли оно стало основой для прозвища.

Географически фамилия Кубылин (и, соответственно, Кубылина) встречается в основном на Русском Севере и в центральных областях России — в Вологодской, Архангельской, Костромской областях. Это подтверждает связь с северными говорами, где слово «кубыла» было в ходу. Социальный состав носителей фамилии в прошлом — преимущественно крестьяне и посадские люди, так как фамилии на -ин чаще всего образовывались в низших сословиях, в отличие от дворянских фамилий на -ов/-ев.

Ономастика здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на патроним (отчество) или матроним, а основа — на конкретное прозвище. Никаких сложных заимствований или тюркских корней искать не стоит — это чисто славянская, бытовая фамилия, образованная от простого и понятного слова. Если ваши предки носили фамилию Кубылина, скорее всего, родоначальник был человеком, чья жизнь была связана с лошадьми, или же его прозвали за внешнее сходство с этим животным.