Фамилия Кулюин — редкая и с неочевидной этимологией. Прозрачных корней вроде «кулик» или «кулак» здесь нет, поэтому разбирать её нужно через географию и словообразовательную модель.

Суффикс -ин указывает на принадлежность по отцу: Кулюин буквально значит «сын Кулюя». Основа Кулюй — это либо прозвище, либо производное от личного имени. В русской ономастике прозвища на -уй (Хапуй, Грызуй, Лизоблюй) обычно имели ироничный или бытовой оттенок, описывали манеру поведения. Но есть и другая версия: Кулюй может быть искажённой формой крестильного имени, например Кирилл (в народной речи — Курил, Кулюй) или Каллистрат. В северных говорах, где звук «р» иногда выпадал, такое превращение вероятно.

География фамилии подсказывает, что её носители — из северных или вологодских земель. В метрических книгах XIX века Кулюины встречаются в Вологодской губернии, реже — в Архангельской. Это подтверждает связь с севернорусским говором, где слово «кулюкать» означало «плохо, невнятно говорить», а «кулюка» — заика или неразборчивый человек. Прозвище Кулюй могли дать косноязычному или нелюдимому человеку.

Однокоренных фамилий мало: Кулюкин, Кулюков, Кулюгин — все они редки и тоже тяготеют к Русскому Северу. В списках однодворцев и крестьян Кулюины не фигурируют как дворянский род — скорее всего, фамилия закрепилась в крестьянской или мещанской среде не позднее XVII века, когда в Поморье начали активно оформляться родовые прозвания.

Спор о происхождении остаётся: либо это прозвище от диалектного глагола, либо народная переделка церковного имени. Первая версия правдоподобнее из-за типичной для северных говоров модели прозвищ на -уй и отсутствия устойчивых параллелей в святцах. Фамилия Кулюин — редкий пример того, как местная речь сохранила слово, почти исчезнувшее из литературного языка.