Фамилия Кунецова — это женская форма фамилии Кунецов, которая встречается заметно реже, чем её «звонкий» аналог Кузнецов. Разница в корне — всего одна буква, но она меняет всю историю происхождения.

Самая вероятная версия: в основе фамилии лежит не ремесло, а прозвище или мирское имя. В северных и сибирских говорах «кунец» — это не кузнец, а куница, либо мех куницы. Человек мог получить прозвище Кунец за ловкость, хитрость, смуглый цвет лица («тёмный, как куница») или за то, что промышлял этим зверьком. В старых писцовых книгах XV–XVI веков встречаются имена Кунец и Куница (например, крестьянин Кунец Иванов, 1495 год, Новгород). Фамилия Кунецов, а значит и Кунецова, могла образоваться от такого прозвища через притяжательный суффикс -ов: «чей сын?» — Кунецов.

Менее распространённая, но возможная версия — диалектное искажение слова «кузнец». В некоторых говорах (особенно на западе и юге России) звук «з» перед «н» мог оглушаться или выпадать: кузнец → кунец. Аналогичный процесс мы видим в фамилиях Гвоздев (от гвоздь) и Гвонздев. Однако в случае с Кунецовым это редкий вариант: обычно фамилию «правили» под литературное произношение, поэтому Кузнецовых в России в десятки раз больше.

Географически фамилия Кунецова не привязана к строго одному региону, но заметно чаще встречается в Вологодской, Архангельской областях и в Сибири — то есть там, где был развит пушной промысел и где сохранялись архаичные говоры. В Москве и центральных областях она редка, что косвенно подтверждает её «северное» прозвищное происхождение.

Таким образом, предки Кунецовой в подавляющем большинстве случаев не были кузнецами. Скорее всего, это был человек, связанный с охотой на куницу, либо носивший прозвище Кунец за внешность или характер. Фамилия сохранила диалектную черту, которая со временем стала её отличительным признаком.