Фамилия Куникин является самобытным памятником славянской культуры. Фамилия Куникин образована от прозвища Куника, которое, по одной из версий, связано со словом «куница». Подобные прозвища, образованные от названий животных, были широко распространены в старину. Вероятно, прозвище Куника мог получить ловкий и опытный охотник, занимавшийся отловом куниц. Возможно также, что предок обладателя фамилии Куникин был богатым и зажиточным торговцем. Согласно другой версии, прозвище Куника восходит к тюркскому слову «qonaq», что переводится как «гость». На Руси так называли хорошего знакомого или близкого друга. Не исключено также, что прозвище Куника связано с диалектным глаголом «кунять» - «дремать сидя, клевать носом». В этом случае, Куником могли прозвать соню, лежебоку. Так и прозвище Куника закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Куникин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Куника, со временем получил фамилию Куникин. Безусловно, фамилия Куникин представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Куникин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.