Фамилия Купченков — это отчество второго порядка, то есть «внучий» патроним. Если развернуть цепочку, получается: Купец — Купченко — Купченков. Иными словами, Купченков — это сын Купченко и внук человека по прозвищу Купец. Прозвище Купец, как и многие другие, относилось к так называемым «профессиональным» именованиям и указывало на род занятий предка. Однако не стоит думать, что каждый Купец был богатым торговцем: в крестьянской среде так могли назвать любого, кто торговал, менял или перепродавал товар, а также человека, который ездил «по купеческим делам» за общину.

В словообразовательной модели фамилии есть любопытная деталь. Суффикс -енк- в основе Купченко типичен для украинской и южнорусской ономастики: он образует патроним (сын Купца). А вот окончание -ов на конце уже обрусевшей фамилии — это чисто северорусский или центральнорусский способ адаптации. Так что предки Купченковых, вероятно, пришли на Русь с юга, но со временем фамилия закрепилась в великорусском варианте.

География бытования фамилии тоже показательна. Купченковы чаще всего встречаются в Курской, Орловской, Белгородской и Воронежской областях — то есть как раз на границе исторической Великороссии и Слобожанщины, где украинские и русские фамильные модели смешивались особенно активно. Встречается фамилия и на Дону, что подтверждает версию о южном происхождении основы.

Самый редкий и спорный момент — могло ли прозвище Купец быть не профессиональным, а ироничным. В народе купцом нередко дразнили бедняка, который «важничал» или пытался жить не по карману. Однако для фамилии Купченков такая версия менее правдоподобна: суффикс -енко чаще прикреплялся к реальному занятию, а не к насмешливому прозвищу. Более того, в документах XVII–XVIII веков по южным уездам встречаются записи о «купченках» — мелких торговцах или приказчиках, что прямо указывает на профессиональный корень.