Фамилия Кууль — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, и её происхождение почти наверняка не славянское. Скорее всего, перед нами фамилия, принесённая в Россию переселенцами или соседними народами.

Самый вероятный источник — прибалтийско-финская языковая среда. В эстонском языке слово kool означает «школа», а kuul — «пуля» или «шар». Однако фамилия Кууль могла возникнуть и от личного имени или прозвища. В финской ономастике встречается фамилия Kuula (с долгим гласным), но написание «Кууль» характерно для эстонского или водского произношения. Есть и другая версия: фамилия могла быть образована от шведского kul — «уголь» (через диалекты островных шведов Эстонии). В любом случае, корень не славянский.

Географически фамилия Кууль привязана к Северо-Западу России. Она встречается среди ингерманландских финнов, эстонцев и сету, а также у русского населения, веками жившего бок о бок с этими народами в Петербургской, Псковской и Новгородской губерниях. Встречаемость крайне низкая — это не массовая, а локальная фамилия, сохранившаяся в нескольких родах.

Словообразовательная модель проста: фамилия не имеет русского суффикса, она застыла в форме чистого корня. Такое возможно, если фамилию записывали при переписи прямо с произношения, без адаптации. Носитель фамилии Кууль в XIX веке — скорее всего, крестьянин или ремесленник из прибалтийско-финского анклава. Дворянского сословия с такой фамилией в старых родословных книгах нет.

Споров среди этимологов почти нет — версия о неславянском происхождении единодушна. Разногласия касаются только конкретного языка-донора: эстонский, финский или карельский. Правдоподобнее всего эстонская основа, учитывая ареал бытования и типичное для эстонских фамилий окончание на согласный.