Фамилия Кузенов в своей основе имеет мужское личное имя Кузьма. Греческое слово «косма» означало «мир, порядок, мироздание» и в переносном смысле — «украшение». В народной речи имя Кузьма дало множество уменьшительных и производных форм, одна из которых — Кузен — и легла в основу фамилии. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Кузенов буквально значит «сын Кузена» или «потомок Кузена».

Существует и другая версия: прозвище Кузен могли дать человеку, который приходился кому-то двоюродным братом (от французского cousin, хотя в русских говорах это слово тоже бытовало). Однако эта гипотеза менее правдоподобна. Во-первых, прозвища по степени родства обычно указывали на более близкие отношения (например, «Брат» или «Дядя»), а «кузен» звучит книжно и скорее могло быть шутливым прозвищем, чем устойчивым именованием. Во-вторых, для русской ономастики гораздо естественнее образование фамилии от канонического имени Кузьма через его народную форму, чем от заимствованного термина родства.

Таким образом, в подавляющем большинстве случаев фамилия Кузенов — это типичная «отчество»: её получил потомок человека, которого в быту звали Кузеном, то есть уменьшительно-ласкательной формой от Кузьмы.